Cuando un amigo de Steve, agente de la CIA, es asesinado, McGarrett se deja capturar por el grupo que cree responsable y soporta sus torturas para encontrar al asesino. Además, Tani no sabe si hablar con McGarrett sobre el arma homicida que encontró en la casa de Adam.

Cuando un padre que se dirige a Honolulu en avión para disfrutar de sus vacaciones es secuestrado y forzado a lanzarse en paracaídas, Danny, Tani y Junior lo rastrean a través de la jungla y descubren que puede que no sea quien parece. Además, McGarrett es amenazado con un secreto de su pasado.

El crimen aumenta cuando una ola de calor golpea a Oahu, llevando a McGarrett y Danny tras un ladrón de bancos, y el coche de Tani y Junior es robado mientras están de servicio. Además, Grover juega el partido de golf de su vida, y Kamekona incita unos disturbios por la subida de precios de sus helados.

Jerry acompaña a Junior mientras escolta a un soldado caído hasta su casa en Oahu. Además, McGarrett y Danny descubren un cadáver cuando se adentran en el ilegal y oscuro mercado negro de arena.

En Halloween, Jerry y sus amigos rastrean en un campamento de su niñez, las pruebas de un asesinato que presenció cuando era niño. Por su parte, McGarrett investiga a una niña que dibujó imágenes de la escena de un asesinato reciente antes de que fuera descubierto.

McGarrett cruza la línea y es arrestado mientras investiga la muerte de su ex compañero SEAL, que murió al realizar un aterrizaje de emergencia en un portaaviones, del que únicamente sobrevivió un bebé. Además, Adam regresa a Oahu con noticias malas sobre su matrimonio.

McGarrett investiga un antiguo caso de la década de los 40, en el que trabajaron su abuelo y el famoso detective de Honolulu Chang Apana, tratando de deducir cómo se podría haber resuelto el caso. Además, McGarrett y Danny se preparan para la apertura de su restaurante.

Los padres y el hermano de Grover viajan a Oahu por el Día de Acción de Gracias, aunque la visita se tuerce por la rivalidad entre hermanos. Mientras, el equipo investiga a un ladrón que ha sido aplastado por una caja fuerte vacía.

Un renombrado justiciero muere después de arrestar a un ciudadano, y el equipo se adentra en el mundo de los superhéroes y cómics para encontrar al asesino. Además, Adam se acerca, finalmente, a descubrir quién mató a su hermana.

Después de pelear con un asesino en su propia casa, McGarrett y Joe White huyen a Montana para prepararse para una batalla contra los que exigen venganza por una misión anterior SEAL.

Todavía aturdidos por el asesinato de uno de sus ohana, Steve y Catherine, junto a Danny, Junior y sus viejos amigos, Harry Langford y Wade Gutches, persiguen al asesino. Además, Tani y Grover investigan la desaparición de una bolsa de huesos humanos encontrada en un trastero abandonado.

McGarrett y el equipo apoyan a Danny y Rachel al determinar lo que ha sucedido cuando Grace sufre un grave accidente de coche; Tani ayuda a Koa cuando su paciente de rehabilitación desaparece.

Adam, Junior y Tani viajan al fondo del Océano Pacífico cuando hay un asesinato en un remoto laboratorio submarino y el asesino aún puede estar a bordo.

Mientras investigan el asesinato de los amigos de Flippa, McGarrett y Grover desenmascaran un plan mortal de un grupo extremista en la isla. Además, Grover tiene una reacción emocional al caso.

Mientras un peligroso huracán golpea a Oahu, el equipo debe proteger al Diablo, un asesino en serie bajo custodia al que intenta dar caza un asesino. Además, el control de seguridad civil de Tani durante la tormenta resulta mortal y Rachel y Charlie son evacuados a la casa de Danny, donde ambos tienen recuerdos.

Cuando la mejor vendedora de una compañía de belleza de sistema piramidal es asesinada, el equipo revisa una larga lista de posibles sospechosos que querrían su muerte. Además, Adam se hace amigo de un sin techo alejado de su familia.

Junior está dividido entre su deber como miembro del 5.0 y sus sentimientos por su ex novia cuando su nueva pareja, el padre de su hijo, es uno de los culpables del robo a un banco que acabó en homicidio.

Tani y Junior van se encubren en un gimnasio para rastrear unos esteroides que provocan la muerte a los usuarios. Además, Danny y MacGarrett hacen de guardaespaldas para Amanda Savage, ex suegra de Danny y famosa novelista romántica con quien nunca se ha llevado bien.

El equipo investiga el asesinato de un limpiador de ventanas y descubre que la víctima es en realidad un artista callejero de renombre con una posible recompensa por su cabeza debido a motivos políticos. Además, Grover y Adam investigan el asesinato de un apostador, y Junior ayuda a su padre cuando recuerdan la muerte de su hermana.

El equipo debe encontrar a una adolescente que compró un arma a un drogadicto y descubren que el arma, a lo largo de décadas, ha tenido algún efecto en sus vidas.

El equipo investiga el asesinato de un hombre cuyo cuerpo puede tener la clave para un caso de hace 20 años que involucra a una niña secuestrada cuyo padre nunca dejó de buscarla.

Mientras Adam investiga el asesinato de un agente encubierto del FBI a punto de casarse con la hija de un líder de la Yakuza, Noelani es secuestrada y forzada, junto con su mentor, el Dr. Chu, a operar a punta de pistola a un criminal.

Mientras McGarrett ayuda a su hermana Mary, que está de visita, a espiar a sus extraños vecinos, el equipo investiga el asesinato de un conductor y su acompañante. Además, el equipo se burla de los miembros más jóvenes de la unidad cuando Junior acompaña a Tani a una boda.

El fugitivo pirata informático Aaron Wright reaparece para pedirle ayuda al equipo cuando sus compañeros de trabajo en la NSA, para los que ha estado trabajando, son asesinados. Además, Junior testifica en el juicio para la libertad condicional del conductor ebrio que mató a su hermana.

El equipo continúa persiguiendo al criminal Aaron Wright antes de que pueda vender armas cibernéticas al mejor postor; Las vidas de McGarrett y los miembros del equipo corren peligro cuando un visitante se presenta en la sede dispuesto a vengarse.