La historia sigue a Brian Sinclair, un escritor en plena crisis creativa. Su cuñado le descubre una droga muy potente llamada NZT, que maximiza su inteligencia y le facilita la labor de escritura. Así, el protagonista se convierte en uno de los mejores escritores de Nueva York y, colabora con el FBI en la resolución de casos. Pero no es oro todo lo que reluce y Sinclair pronto descubrirá los extraños efectos secundarios.

Brian arriesga su nuevo trabajo en el FBI cuando desobedece las órdenes de mantenerse al margen de la investigación del asesinato de un renombrado periodista.

Cuando Dixon, un agente retirado del FBI es asesinado, el equipo descubre que el homicidio está conectado con la desaparición de Marcos Ramos, uno de los líderes de un cartel de droga. Mientras tanto, Brian se topa con Shauna, una exnovia que queda impresionada ante la energía de Brian -proveniente del NZT. Brian invita a cenar a Shauna, sin embargo, el efecto de la pastilla ha pasado y la chica lo nota. Temiendo que Shauna haya quedado impresionada por los efectos que el NZT causa en él, Brian le pide un consejo a Rebecca. Por otra parte, la investigación lleva al equipo a descubrir que Ramos fue asesinado por los agentes corruptos con los que trabaja y que estos son los responsables del asesinato de Dixon. Finalmente, Brian es contactado por Sands, un hombre que trabaja para Eddie Morra y quien le dice que comenzará a darle tareas para realizar y en caso de no hacerlo arremeterá con las personas que ama, incluida Shauna por lo que Brian se ve obligado a romper nuevamente con ella.

La lealtad de Brian al FBI es puesta a prueba cuando Sands le exige que robe el archivo secreto correspondiente al NZT.

Brian se entera de un secreto impactante sobre el difunto padre de Rebecca, pero le preocupa que al decírselo, él caerá en problemas legales. Además, Brian se mete accidentalmente en la vida personal de Rebecca mientras aprenden autodefensa de su novio secreto, el agente del FBI Casey Rooks.

La salud física y mental de Brian empieza a empeorar de nuevo.

Brian se toma un día libre (al estilo de Ferris Bueller) pero todo sale mal cuando es secuestrado por la CIA, que necesita sus habilidades NZT.

Cuando Naz está detenido debido a la sospecha de financiación del terrorismo, los esfuerzos de Brian y Rebecca por limpiar su nombre les llevan hasta la hija de Naz, Ava, que revela un secreto de familia que Naz está protegiendo del FBI.

Brian insta a Naz a crear su propia "Sede" personal, y le ofrece la captura de diez delincuentes más buscados por el FBI como moneda de cambio.

Un viejo amigo de Boyle tiene la teoría de que alguien le cortó su brazo ortopédico y lo utilizó para asesinar a su esposa e inculparlo a él, por lo que Boyle pide a Brian que lo ayude a probar su inocencia.

Cuando el agente Casey Rooks y su equipo de SWAT requisan 80 pastillas de NZT para la recuperacion de un inventario robado, ello desencadena una investigacion interna que es vista a traves de las perspectivas cambiantes del circulo cercano a Brian en el FBI.

El senador Edward Morra es el objetivo del que podría ser un asesino, y Brian recibe la orden de sabotear la investigación del FBI sobre el intento de asesinato con el fin de evitar la exposición de la conexión del senador con la NZT.

Brian se embarca en su primera misión en el campo del FBI para prestar sus habilidades a la unidad encargada de la captura de asesinos en serie, pero pronto se da cuenta de que han distanciado a un inocente. Mientras tanto, Brian trata de evitar que Rebecca descubra la conexión del senador Murray con la NZT.

Brian persigue a un ladrón que ha robado copias digitalizadas de las mentes más brillantes del mundo. Rebecca se encuentra más cerca de descubrir la verdad detrás de las malas influencias de Morra.

Despues de filtrarse una lista con las identidades reales de agentes de encubierto del FBI, Brian desarrolla una conexion personal con la agente del FBI Lucy Church, una tenaz rompedora de reglas, cuando el le ayuda a terminar un caso de campo antes de ser expuesta. Sands hace un movimiento sorprendente para acabar con la investigacion de Rebecca sobre el Senador Morra.

Sands precisa la ayuda de Brian para eliminar una amenaza que debe ocultarle al senador Morra.

Brian y Rebecca son puestos en cuarentena por el CDC luego de haber estado expuestos a una sustancia desconocida

Rebecca está a punto de descubrir el secreto de Brian. Brian opera por fuera del FBI y se va a Rusia para encontrar a la única persona que puede ayudarlo a cortar lazos con el senador Eddie Morra.

Brian regresa de Rusia y nuevas reglas son establecidas por Naz para mantener el cerebro debajo de sus ojos, Rebecca sospecha sobre Brian y su relación con Sand.

Rebecca descubre la verdad sobre la muerte de su padre y toma NZT por primera vez para vengar su muerte.

Cuando un brote CST provoca el caos en la ciudad de Nueva York, Brian se ve obligado a investigar por su cuenta porque el FBI no lo deja.

Siguiendo de la impactante traicion a su equipo, Brian y el FBI corren para detener a un Sands y sus asociados de orquestar un incidente internacional. Brian experimenta los devastadores efectos secundarios cuando su inmunidad al NZT empieza acabarse.