Usando un móvil y un balón de fútbol, MacGyver y el equipo buscan a un SEAL de la Marina que creen vivo pero en cautiverio en el Medio Oriente.

Utilizando un collar y un transmisor de microondas, Mac y el equipo intentan localizar a Riley después de que su primera misión en solitario con un grupo de hackers peligrosos descarrile.

El equipo tiene que entrar en la cámara de un casino de Europa del Este y robar una fortuna en diamantes que un grupo terrorista planea usar para comprar armas de destrucción masiva.

Murdoc captura a Mac como parte de su nuevo plan, que además involucra a un maestro de escuela llamado Henry.

Cuando Halloween se acerca, Matty envía al equipo al Triángulo de las Bermudas para rescatar a un escuadrón de soldados cuando su avión se cae mientras transportan a un misterioso prisionero.

Utilizando un reproductor de casetes y un cubo de plástico, Mac y el equipo intentan extinguir un fuego masivo en un pozo de petróleo de una aldea nigeriana, causado por un grupo rebelde que intenta derrocar a su gobierno destruyendo su recurso más valioso.

MacGyver usa un calentador y salsa de tabasco para ayudar a un candidato presidencial clave en Ecuador a recibir un trasplante de corazón que necesita desesperadamente después de que un grupo rebelde intenta sabotear la entrega del órgano.

Mientras el equipo roba una pintura muy codiciada para atraer a un comerciante de arte y financiero terrorista, Wilt encuentra un misterio mientras asiste a un entrenamiento. Mientras, el padre de Riley intenta acercarse a ella para volver a formar parte de su vida.

El equipo persigue a un terrorista que ha enviado un mercenario para recuperar un bote de gas nervioso robado. Mientras, Jack da una advertencia a Elwood, y Wilt se enfrenta a una importante prueba en la escuela de espionaje.

Cuando 32 estudiantes universitarios se quedan varados en un barco de investigación en el Océano Ártico sin fuego y con incendios en erupción, Mac experimenta una conexión emocional con el líder del grupo, a través del video chat, mientras le transmite cómo mantenerse con vida mientras esperan un barco de rescate. Además, Jack secuestra a Elwood para descubrir qué estafa está planeando, y los sentimientos de Bozer por Leanna aumentan.

La policía de Los Ángeles interrumpe la celebración navideña del equipo para arrestar a Mac por terrorismo doméstico, cuando encuentran un cuerpo en un edificio destruido por una bomba que Mac construyó durante una misión en Los ángeles.

Cuando Mac y Jack quedan atrapados en la casa de Mac debido a que su mayor enemigo," El fantasma", la ha manipulado con explosivos, Mac usa un micrófono de karaoke y un transformador de audio para hacerle saber al equipo que esta bomba es una distracción de una mayor aún. Además, a través de flashbacks, se desarrolla la primera reunión polémica entre Mac y Jack.

Mientras Mac participa en un desafío para que los agentes del gobierno creen máquinas de combate robóticas, Mac debe ayudar a su mayor competidor, Allie, cuando su vehículo es pirateado y se dirige al Pentágono. Además, Jack asiste a su reunión de la escuela secundaria, con la esperanza de un enfrentamiento con su antiguo rival que le ganó como rey del baile de graduación.

Cuando el equipo se dirige a Nueva Orleans para localizar a la estafadora que se hace pasar por la esposa de "Duke Jacoby", uno de los viejos alias de Jack en la CIA, Jack se encuentra en peligro cuando los viejos enemigos de "Duke" resurgen buscando venganza.

Cuando uno de los asesinos de Murdoc acepta entregarle a cambio de 10 millones, el equipo se encuentra protegiendo a Murdoc de su antiguo mentor, Nicholas Helman, que lo quiere muerto. Además, Jack se da cuenta de que aún puede sentir algo por la madre de Riley, Diane.

MacGyver, Leanna, Riley y Bozer se hacen pasar por parejas de luna de miel en un resort para obtener información sobre un criminal de guerra serbio de su hijo recién casado. Además, Bozer se pregunta si Matty sabe sobre su relación con Leanna, y Jack recluta a Elwood para ayudarlo a entrar a la casa de Matty.

Mac, Jack y Riley se disponen a buscar a un mafioso reconvertido en informante cuando es secuestrado y llevado a Chernobyl por un criminal internacional preocupado por la posibilidad de ser incriminado ante la CIA. Además, Bozer lucha por mantener un secreto a salvo de Matty.

Los agentes de Phoenix persiguen a un traidor que ha sido descubierto por un oficial de policía al que mató tras desenmascararle, y se enfrentan a los Colton cuando los cazarrecompensas persiguen al mismo hombre.

Jack descubre que Dawn vive en LA, y que trabaja para la CIA. A su vez, Dawn les dice que su supervisor fue asesinado investigando a uno de sus superiores que estaba fabricando pasaportes falsos.

Mac y Jack intentan rescatar al hijo de un multimillonario después de que él es secuestrado por un ex SEAL de la Marina que usa un arma EMP para cortar la corriente eléctrica y las líneas de comunicación al rascacielos de Shanghai donde vive el niño.

Mac y sus amigos viajan a Puerto Rico para ayudar a un amigo de Mac a construir un nuevo hogar después del huracán María y además, para involucrarse con ladrones de bancos.

Mac y Riley son atacados por un grupo de hombres enmascarados tras una llamada del gobierno para que examinen un misterioso objeto que se estrelló en el desierto de Nevada. Además, Riley descubre nueva información sobre el padre de Mac, pero duda sobre si revelársela a Mac cuando éste menciona que necesita dejarlo atrás.

Mac encuentra a su padre, y de inmediato se ve arrastrado al caso de un cártel que está tratanto de fabricar una droga que mejore el rendimiento. Mientras, Wilt descubre que Leanna ha recibido una oferta de trabajo en Phoenix, y Riley considera un cambio de carrera.