Después de la misteriosa dimisión de su antecesor, Elizabeth McCord (Téa Leoni), antigua asesora de la CIA y ahora profesora universitaria y madre de familia, acepta el cargo de Secretaria de Estado de EE.UU. propuesto por el presidente. Tendrá que lidiar con crisis internacionales, con conspiraciones dentro de su propio Gobierno y con las consecuencias de su nuevo trabajo en su vida familiar.

Elizabeth McCord lucha por encontrar una solución políticamente correcta para solventar definitivamente la crisis creada en la Embajada de Yemen. Pero de vuelta en casa, su hija mayor, Stevie, sale en los titulares de los periódicos tras organizar una protesta universitaria.

Elizabeth se ve obligada a pedir excusas cuando un periodista publica unos documentos confidenciales que demuestran que el Departamento de Estado está en un compromiso a nivel internacional. Mientras tanto, Henry se pone en una situación difícil cuando el Ministro de Exteriores de Rusia le pide que le ponga a su hija un sobresaliente en clase de ética, a pesar de que la muchacha apenas llega al aprobado.

Elizabeth está trabajando para negociar un tratado de paz entre China y Japón. Cuando parece que el proceso está llegando a buen puerto, un estudiante chino en busca de asilo político amenaza el acuerdo. En casa, las tensiones estallan entre Alison y Stevie durante la fiesta de pijamas de Alison.

Elizabeth se enfrenta a la difícil tarea de negociar con Irán sobre la escalada apercibida en su programa nuclear. Decidida a hacer frente tal situación de una manera pacífica, Elizabeth tiene que ser creativa cuando el presidente parece decidido a emprender una acción militar. Mientras tanto, el respeto de Jason hacia Henry crece a medida que éste le entrevista para un trabajo del colegio.

Elizabeth le pide al Presidente que le ayude en el caso de la complicada situación que se está viviendo en la República de África Occidental (RWA), que está a punto de embarcarse en una campaña de limpieza étnica contra el pueblo Beko; entonces se enfrentará a algunas circunstancias imprevistas. Además, Elizabeth tiene que prepararse para su primer discurso ante el Comité de Asuntos Mundiales.

En el transcurso de un viaje que Elizabeth McCord realiza a la India para dar un discurso sobre un proyecto conjunto entre la India y Estados Unidos, sucede un terremoto y la Secretaria de Estado pierde la pista de Alison. Mientras tanto, en casa, Stevie verá a su padre con otra mujer y entonces comenzará a sacar conclusiones equivocadas.

Henry es reactivado de nuevo en la NSA bajo las órdenes del Presidente, pero decide mantener muy en secreto su juego de espionaje para que Elizabeth no se entere. Mientras tanto, el enfrentamiento entre Matt y Daisy comienza a ser incómodo en toda la oficina.

Elizabeth, Henry e Isabelle inician una investigación sobre el accidente aéreo que mató al que fue Secretario de Estado antes que Elizabeth: Vincent Marsh. Además, Nadine aceptará acudir a una cita con un científico de la NASA.

El Departamento de Estado continúa aislado debido a un pistolero desquiciado que se encuentra fuera del edificio, Elizabeth está confinada junto con una delegación de Irak, y un traductor que amenaza con revelar información perjudicial sobre sus acciones mientras Elizabeth servía a la CIA. Mientras tanto, Matt también se encuentra atrapado en una oficina y en una situación incómoda, con el novio de Daisy: Win.

Elizabeth, Henry e Isabelle indagan hasta encontrar la cuenta secreta que el ex Secretario de Estado, Vincent Marsh, tenía en Venezuela y descubren que uno de los empleados de la Casa Blanca puede acceder a ella ya. Todo apunta a que se trata de una cuenta que recoge fondos para la campaña presidencial por lo que Elizabeth convence a su equipo de que la siguiente misión diplomática internacional se haga en Venezuela para llegar al fondo del asunto.

Henry está en la ciudad de Nueva York para celebrar su 25 aniversario de boda junto a Elizabeth. Sin embargo, una crisis de trabajo interfiere con sus planes cuando surgen problemas políticos en el caso de un contrabandista del cártel mexicano que mató a un policía del estado de Texas. Mientras tanto, Jason se lesiona a sí mismo mientras está al cuidado de Blake.

Elizabeth es informada de que un diplomático de Bahrein y su esposa mantuvieron a su ama de llaves como un esclava, encerrada en una pequeña habitación en su casa de Washington los últimos tres años. Desafortunadamente, al ser diplomático, está protegido por la inmunidad y Bahrein quiere barrer bajo la alfombra. Para más complicaciones, Estados Unidos tiene una base militar en Bahrein, junto a Irak e Irán. El gobierno de EE.UU. no quiere arriesgar el puesto crucial, pero Elizabeth quiere hacer lo correcto.

Elizabeth Faulkner contrata a un asesor especial después de que la Secretaria de Estado haya sido humillada en una audiencia pública debido al hecho de que su equipo no pudo encontrar la presunta corruptela existente en su programa de microcréditos; al mismo tiempo, continúa la investigación sobre la muerte de Marsh.

La Secretaria de Estado Elizabeth Faulkner viaja a Turquía para reparar las relaciones políticas con el país, después de que el gobierno turco lanzase un video que podría resultar muy perjudicial para la CIA. De vuelta en casa, Jason se enfrenta a expulsión como castigo después de haberse enfrentado a un matón en la escuela.

Elizabeth viaja en secreto a Irán para tratar de frustrar un golpe que podría afectar a la administración del presidente Dalton. Además, Elizabeth también pondrá al corriente a su personal sobre la investigación de la muerte de Marsh.

Elizabeth trata de superar los hechos acontecidos en Irán, al mismo tiempo que trabaja para prevenir un desastre ecológico en el Amazonas, y se prepara para una aparición televisiva que verá toda la nación.

Al mismo tiempo que Elizabeth trata de buscar una solución diplomática a una secta destructiva y apocalíptica localizada en Bolivia, un congresista que trata de negociar con el líder de la organización es secuestrado y tomado como rehén.

Elizabeth y el Presidente Dalton trabajan juntos para solucionar la crisis de deuda griega, pero no todo el mundo estará contento con el acuerdo alcanzado. Mientras tanto, Henry considera una nueva oferta de trabajo, y Stevie reconecta con un amigo de la infancia: el hijo del Presidente.

Mientras Henry está en Rusia dando lecciones sobre el fundamentalismo, Elizabeth navega en aguas políticamente turbulentas cuando un submarino nuclear ruso desaparece misteriosamente en aguas americanas. Mientras tanto, Stevie rompe con su novio.

Mientra Elizabeth se prepara para recibir al Presidente de Irán, Shiraz, para firmar un tratado nuclear entre los dos países, se descubre un plan secreto que tiene como objetivo asesinarle en terreno americano. Al mismo tiempo, tendrá que enfrentarse a una gran protesta a favor de los derechos humanos en respuesta a los planes de Irán de condenar a muerte por lapidación a un ciudadano homosexual.

Final de tempoada. Cuando Elizabeth se enfrenta a su antigua amiga Juliet, acusada de traición, recuerda el momento en el que el director de la CIA le ofreció un trabajo que hubiera cambiado totalmente su vida. Además, Stevie y el hijo del Presidente, Harrison, comienzan una relación.