Un hombre joven nombrado Cole, que fue criado en la jungla, deja su hogar en la selva para encontrar a sus padres verdaderos. Su viaje lo lleva a los Wild Force Rangers, en la ciudad de Turtle Cove y descubre una isla llamada Animarium. Esta isla flota en el cielo sobre la ciudad y es el hogar de las bestias legendarias de una civilización antigua, donde él los ensambla en la lucha contra los Orgs malvados como el Ranger Rojo.

Amo Org vuelve a allanar, y comienza a trazar la destrucción de la humanidad. Los Wild Force Rangers descubre que pueden combinar su Wild Zords en el Wild Force Megazord. Los malvados Jindrax y Tóxica encuentran el Nexus, la cuna de los Orgs, debajo de la ciudad de Turtle Cove. Con la esperanza de encontrar allí al Amo Org, encuentran una encarnación algo diferente de su maestro, quien las intimida para que lo sigan.

En el Animarium, la Princesa Shayla le cuenta a Cole sobre lo que sucedió hace 3000 años. Le explica cómo se creó el Animarium luego de que el Reino de Animaria cayera en manos de los Orgs durante una gran batalla.

Cuando Danny se encuentra con su viejo amor, Kendall, inmediatamente se vuelve a enamorar. La amistad entre Danny y Max es puesta a prueba cuando Kendall roba su atención. Cuando Bell Org captura a Max, Danny recuerda que le debe la vida.

En una excursión para su clase de arqueología, Alyssa descubre, en una cueva, un símbolo que hace juego con la hebilla de su cinturón Ranger. La Princesa Shayla y Cole acompañan a Alyssa a la Tierra a investigar pero el Tire Org captura a Shayla.

Alyssa les lee un cuento a Max y a Danny sobre alguien que arrojó una botella con un deseo hacia el Turtle Lake para que se le conceda. Mientras tanto, los Wild Force Rangers pelean contra el Ship Org y Max tiene visiones recurrentes del Megazord en batalla.

Taylor se encuentra con dos mellizos misteriosos vestidos de blanco y negro que se escabullen por su vieja Base Air Force. Ella recuerda cómo descubrió el Animarium hace un año y cómo se la considera Perdida en Acción hace un año.

El Red Lion Zorg está herido y Cole y el resto de los Wild Force Rangers salen a buscar al mítico Soul Bird. Mientras tanto, Jindrax y Tóxica reclutan al Bull Dozer Org para nivelar el bosque antes de que los Wild Force Rangers puedan hallar lo que buscan.

Jindrax y Tóxica encuentran al General Org Retinax, vagando sobre las vías del tren. Retinax era el guardaespaldas del Amo Org hace 3000 años y desde entonces ha vagado la Tierra, avergonzado por no haber podido evitar su destrucción.

Por medio de su vara mágica, el Amo Org transforma una antigua estatua en Nayzor, un poderoso General Org. Bajo las órdenes del Amo Org, Nayzor libera al duque Org Zen-Aku de la tumba que lo mantuvo atrapado por 3000 años.

La Princesa Shayla cura las heridas de los Wild Force Rangers luego de la desastrosa batalla contra el malvado Duke Org Lobo Zen-Aku. Mientras tanto, Alyssa busca su cristal en secreto y Nayzor le exige a Zen-Aku el Cristal Elefante.

Max se ve forzado a entregar su Cristal Jirafa a Tóxica a cambio de la seguridad de los pasajeros de un autobús fuera de control. Cuando Max y Alyssa evacúan a los pasajeros, el autobús se convierte en el Bus Org.

Mientras Zen-Aku secuestra a la Princesa Shayla, Taylor se enfrenta a un Org que no pudo vencer en su primera misión como Ranger. Para empeorar la situación, Zen-Aku logra robarse los cristales del Oso de Taylor.

Luego de que Zen-Aku les quitara los cristales, los chicos, angustiados, deciden recuperarlos. Los Wild Force Rangers utilizan su Wild Force Megazord para enfrentarse a Zen-Aku. Cuando comienza la batalla entre ellos, aparece una figura misteriosa en el cielo.

Zen-Aku tiene la memoria bloqueada y obedientemente le da a Nayzor los cristales robados a los Wild Force Rangers. Luego, Nayzor le ordena a Zen-Aku que destruya a los Wild Force Rangers. Durante un eclipse lunar, Zen-Aku vuelve temporalmente a su forma humana: Merrick.

Los Wild Force Rangers rompen la maldición de Zen-Aku y Merrick debe decidir si unirse a los Wild Force Rangers o seguir por su cuenta. Con la intención de engañar a Jindrax y Tóxica, Merrick les pide que lo lleven con el Amo Org.

Merrick se ajusta a la vida del siglo XXI y defiende una parada rural de un grupo de vándalos. El dueño, Willy, acoge a Merrick. Mientras, Jindrax quiere convertirse en general pero aparece el nuevo General Org, Necronómica.

Alyssa y Cole buscan información sobre los padres de Cole en la biblioteca. Antes de encontrar información útil, los otros Wild Force Rangers los llaman para luchar contra monstruos Org. Durante la batalla, hieren a Cole, quien ahora sufre de amnesia.

Max debe convencer a su mentor de bolos, Don, de que ayude a los Wild Force Rangers contra el Bowling Org. Él reflexiona sobre cómo debió rechazar la oportunidad de aprender de Don cuando fue reclutado para convertirse en un Power Ranger.

Los Wild Force Rangers deben pelear contra el Wedding Dress Org para evitar que las novias sean convertidas en maniquíes mientras Danny compite con otro hombre por el amor de Kendall. Él está preocupado de no poder competir con su adinerado rival.

El padre de Alyssa llega a Turtle Cove a visitarla. Decepcionado de ver que ella descuidó la tradición familiar de las artes marciales, la regaña. Pero se sorprenderá al verla pelear junto a los Wild Force Rangers.

Dado por muerto en el mundo moderno, el Amo Org halla su tumba y crea al Tombstone Org con ella. Mientras pelean contra ese Org, los Wild Force Rangers descubren al Deer Zord, una criatura salvaje que reconoce a Merrick pero le guarda rencor.

Por medio de la corona de Nayzor, el Amo Org, Super Jindrax y Super Tóxica reviven a Nayzor como Super Nayzor para pelear con los Power Rangers Wild Force. En una batalla devastadora, Super Nayzor hiere a varios de los Wild Force Rangers.

Tres Mut-Orgs viajan en el tiempo para ayudar al Amo Org a cambiar la historia. Los Wild Force Rangers se unen a los Silver Guardians para detenerlos. Mientras tanto, un misterioso agente del futuro rastrea a los Mut-Orgs desde las sombras.

Los Wild Force Rangers obtienen refuerzos en la batalla contra los Mut-Orgs cuando los Power Rangers Time Force viajan en el tiempo para ayudarlos. Los Time Force Rangers se unen a los Wild Force Rangers en el Animarium junto con Ransik y Nadira.

El científico Viktor Adler reaparece en Turtle Cove. Cole y los Wild Force Rangers deciden ir al hospital a visitarlo pero luego son capturados. Viktor Adler se revela como el Amo Org y explica su conexión con los padres de Cole.

En el oscuro bosque se unen y recombinan las tres piezas de la máscara rota de Zen-Aku. La máscara levita, llena de nueva energía malvada. Al día siguiente, Merrick practica su Lunar Break en la mesa de billar en Willie's Roadhouse.

Jindrax y Tóxica llevan al General Org Mandilok a la base de operaciones: el Nexus. Llegan para encontrar pilas de escombros que cubren el piso del Nexus; eso es todo lo que queda de los demás Generales Org que fueron aprisionados dentro de estatuas.

Un espíritu Org se mete en una flauta y se convierte en el Flute Org. Para que la melodía de flauta de Merrick no lo sobrepase, el Org comienza a tocar su propia canción. En el Animarium, la Princesa confunde esa horrible melodía con la de Merrick.

En el Nexus, Jindrax decide ir por su cuenta y formar un equipo con su hermano, Juggelo. Ellos intentan atacar al Ranger Amarillo por sorpresa disfrazados de un conejo y un panda, pero fallan continuamente.

Jindrax y Tóxica encuentran al Lion Tamer Org que intenta, sin éxito, domar un gato callejero. El Lion Tamer Org afirma que sólo puede domar animales grandes. Tóxica descubre que podrían reclutarlo para domar los Zords salvajes.

En el Nexus, Mandilok descubre qué tan poderoso es Kite y decide que debe reclutarlo en su equipo. Lleva a Kite a un vertedero donde le explica que los humanos sólo crean basura y contaminan al planeta con ella.

En la Tierra, los Orgs se preparan para el golpe final y envían al Toy Org a atacar una fábrica cercana. Los afligidos Rangers se niegan a volver a la acción sabiendo que no pueden ganar sin sus Zords.

Debajo de la superficie de la luna yace el temido Serpenterra, el Zord más poderoso jamás construido. Por años se mantuvo latente pero ahora las fuerzas del mal han redescubierto a esta colosal bestia.

Furioso con los Duques Org, Mandilok recibe la visita del Duque Org Ninja, Onikage, quien dice tener un plan para vencer a los Wild Force Rangers. Onikage recluta a Jindrax y a Tóxica quienes están dispuestos a ayudar para recuperar la aprobación de Mandilok.

Jindrax piensa en cómo traicionaron a Tóxica y se pregunta si queda alguien en quien confiar. Mientras tanto, a los Power Rangers Wild Force se les aparece una imagen de Onikage, quien les ordena encontrarse con él si quieren volver a ver a la Princesa.

En el Nexus, el Amo Org coloca un extraño artefacto, el 'Corazón Org', en un altar. Mientras tanto, Jindrax toma el espejo de Nayzor con fuerza, deseando que Tóxica estuviera allí. De repente, una voz sale desde lo profundo del espejo.

Jindrax le dice a Tóxica que el Amo Org ha vuelto y tiene a la Princesa. Tóxica descubre que el Amo Org quiere el collar de la Princesa debido a los poderes que oculta. Mientras tanto, los Power Rangers Wild Force buscan el Nexus por cielo y tierra.

Sin más villanos contra los cuales pelear, los Wild Force Rangers descubren que su tiempo como súper héroes podría estar llegando a su fin. Mientras tanto, surge una nueva amenaza de los restos del Nexus y amenaza a la Tierra y al Animarium: El Maestro Org, quien ha adquirido una nueva apariencia. El Maestro Org destruye a los Wild Zords y los poderes de los Wild Rangers, incluyendo los 5 cristales salvajes originales.

El Amo Org continúa destruyendo la naturaleza a sus anchas mientras los Wild Force Power Rangers pelean la última gran batalla por la Tierra. El bien y el mal se enfrentan en una batalla entre fuerzas de Animaria y los Orgs. El Amo Org regresa de su presunta muerte y ataca a los Wild Force Power Rangers con su nueva apariencia. Los Wild Zords regresan junto con otros Wild Zords del mundo, destruyendo al Amo Org con el Ultra Rugido.