El equipo del agente especial Tennant, junto con los agentes del NCIS Nick Torres y Jessica Knight, descubren un plan de ataque en el RIMPAC (The Rim of the Pacific Exercises) en Oahu, el mayor simulacro internacional de guerra marítima del mundo. El crossover comienza en NCIS Navy Investigación Criminal S20E01 Esto queda en familia (I).

Una investigación lleva al equipo a adentrarse en el mundo de las carreras callejeras ilegales después de que se descubra el cadáver de un sargento de la Marina en un desguace. Además, a Tennant le preocupa que Alex le esté ocultando algo, y Whistler está ansioso por presentar a Lucy a sus compañeros de trabajo.

Tennant y el equipo del NCIS sospechan de un juego sucio cuando investigan un accidente de coche mortal en el que está implicado un oficial de la Marina que resulta ser un impostor. Además, Whistler se encuentra en peligro cuando va de incógnito para conocer la verdad detrás del accidente.

Cuando un marinero de la Marina aparece muerto en un lugar sagrado y restringido de kapu, el equipo del NCIS trae al agente especial del CGIS Pike para desenmascarar el misterio y atrapar a un posible asesino en serie en la isla. Además, Tennant conoce a la nueva novia de Alex.

El equipo del NCIS investiga la muerte de un marinero de la Marina y se enfrenta a una despiadada organización criminal local. Además, Lucy busca un nuevo apartamento.

Cuando un cabo de los Marines muere en una piscina de marea tras haber estado expuesto al fentanilo, el equipo del NCIS debe encontrar rápidamente el origen de la droga. Además, Alex habla con sus padres sobre tomarse un año sabático y Ernie revela una noticia personal a Lucy.

Cuando la madre de un niño desaparece, el equipo del NCIS se pone en marcha para encontrarla y se entera de que no son los únicos que la buscan.

Cuando un oficial de la marina es asesinado mientras trabaja en el teatro comunitario, el equipo del NCIS recluta a una cara conocida para que les ayude a llegar hasta un despiadado asesino internacional. Además, Kai recluta a Whistler para abrir una investigación sobre un viejo amigo convertido en criminal.

Cuando la comandante Chase es secuestrada en su casa por un Ranger del Ejército acusado de asesinato, el equipo del NCIS debe actuar con rapidez para encontrarla a ella y al sospechoso.

Tennant, Jimmy Palmer y Sam Hanna son capturados por una mujer que dice ser agente de la CIA y exige información al equipo. Además, Jesse, Ernie, Whistler y Alden Parker se enteran de la llegada a Hawai de un agente que podría estar relacionado con varios asesinatos en el extranjero. El crossover comienza en NCIS Navy Investigación Criminal S20E10 Demasiados cocineros (I). Continúa en NCIS: Los Angeles S14E10 Se veía venir (III).

Cuando el agente especial Pike sufre una emboscada mientras trabaja de incógnito con una familia criminal japonesa local, el equipo debe encontrar al responsable de orquestar los ataques. Además, Kai profundiza en su investigación sobre un viejo amigo convertido en criminal.

Cuando un capitán de las fuerzas especiales de élite de los Marines es asesinado, el equipo del NCIS encuentra a un sospechoso en un lugar realmente inusual.

Tras la explosión de un laboratorio de metanfetamina, el equipo del NCIS se entera de que Kai es el objetivo de su viejo amigo convertido en criminal y debe acabar con él. Mientras tanto, Lucy consigue su primer gran caso a bordo de su portaaviones.

Cuando el asesinato de un capitán y su esposa se hace eco de un caso anterior, el equipo del NCIS trae a un ex miembro del equipo para ayudar a determinar si se trata de un asesino imitador.

Cuando un desertor de la Marina sale accidentalmente de su escondite, su familia se convierte en un objetivo que lleva al equipo del NCIS y a Charlie a investigar quién va tras ellos.

Cuando los residentes de la Marina descubren que sus vehículos fueron robados durante la noche, el equipo del NCIS lo conecta a una serie de crímenes peculiares y sigue la pista de un bandido poco común. Además, Whistler tiene problemas con un informante que no coopera y Alex sopesa sus opciones universitarias.

El capitán Milius regresa a Hawai mientras el equipo del NCIS trabaja para atrapar a un peligroso objetivo de alto valor del Gobierno de EE.UU. con la ayuda de un informante diferente a todos los que se han encontrado.

Cuando Tennant interroga a un sospechoso durante su traslado en helicóptero y éste se estrella, ella debe utilizar sus habilidades para salvarse a sí misma y a los demás pasajeros.

Tras la misteriosa muerte de un astronauta en una simulación de viaje a Marte altamente sensible, el equipo del NCIS debe enviar a Ernie al hábitat para que investigue en solitario.

Cuando Lucy recibe una extraña llamada en la guardia nocturna de un hombre que admite haber cometido un asesinato, el equipo del NCIS se pone en marcha para encontrarlo.

El descubrimiento de un antiguo agente del MI6 muerto desvela secretos del pasado de Tennant, lo que le obliga a llegar hasta las últimas consecuencias para localizar al responsable.

Cuando una figura del pasado de Tennant en la CIA reaparece, el equipo del NCIS busca ayuda en el lugar más insospechado para atrapar a un asesino que amenaza con destruir todo lo que Tennant ha construido.