Una explosión en un evento en Washington, D.C. que se cobra una víctima conectada a la agencia cambia la perspectiva de Parsons sobre Gibbs y el equipo del NCIS. Mientras tanto, sin placas, DiNozzo y McGee investigan el caso como civiles, a pesar de las peligrosas conexiones del caso con cada uno de ellos.

Decidido a localizar a Ziva, Tony investiga en Israel en busca de su paradero actual. Mientras tanto, Gibbs y su equipo continúan la búsqueda de Parsa y su creciente red terrorista.

El equipo del NCIS debe confiar en Twitter por un caso relacionado con la desaparición de un Teniente de la Marina. Mientras tanto, McGee extravía su placa, pero no informa a Gibbs y las autoridades.

Gibbs y McGee viajan a Afganistán cuando un caso de asesinato les lleva a un refugio para mujeres Afganas secretamente apoyado por Mike Franks durante años.

DiNozzo recuerda sus días en el Departamento de Policía de Baltimore cuando ve a un sospechoso de un caso de hace 15 años en la escena del crimen del NCIS de un Suboficial asesinado.

El NCIS se asocia con el Servicio de Investigación de la Guardia Costera (CGIS) para investigar una explosión sospechosa a bordo de una plataforma petrolífera. Mientras tanto, nadie está a salvo de un misterioso bromista que tiene como objetivo al equipo del NCIS.

Después de que Gibbs se vaya a mitad de un caso para ayudar a su padre a reconectar con un ex-piloto de guerra, Tony y McGee discuten sobre quién debería dirigir la investigación del equipo en el asesinato de un Sargento de Marines.

El equipo del NCIS se ve obligado a volver a examinar un caso de homicidio por atropello con fuga cuando un ex-agente del FBI que ahora es abogado abogado confía a Gibbs que la coartada confidencial de su cliente es sólida. Mientras tanto, McGee empieza a sospechar del comportamiento extraño de Tony.

Después de descubrir que han pinchado a la Secretaria de la Marina durante una sesión informativa confidencial, la analista de la NSA, Eleanor "Ellie" Bishop, quien predijo la brecha de seguridad en detalle hace dos años, se une al equipo del NCIS en el caso.

Las complicaciones surgen cuando el equipo del NCIS descubre un vínculo entre una víctima de asesinato y el novio actual de la ex-mujer de Gibbs y el Agente Fornell. Mientras tanto, la analista de la NSA, Ellie Bishop se adapta a unirse al equipo de NCIS.

Después de que una misteriosa enfermedad afecte a los niños de familias militares, Gibbs y el equipo investigan la causa. Mientras tanto, Abby y Jimmy colaboran con el Centro de Investigación Médica Naval para determinar la cepa de la enfermedad, todo con la esperanza de ofrecer una cura antes de las vacaciones. Además, el Director Vance lucha con el perdón cuando su suegro distanciado hace una visita sorpresa a su casa.

Cuando un drone robado está vinculado al terrorista escurridizo Parsa, el equipo del NCIS colabora con el Departamento de Defensa, entre ellos la ex-novia de Gibbs, Hollis Mann, para rastrear el dispositivo antes de que sea usado para un ataque a gran escala. Mientras tanto, McGee vacila en pedir tiempo libre para asistir a una gala de etiqueta en honor de su novia.

En un esfuerzo por encontrar al terrorista Parsa, Gibbs y el equipo del NCIS localizan a uno de sus compañeros utilizando las evidencias del ataque del drone. Mientras tanto, un McGee afectado emocionalmente lucha con las consecuencias del incidente.

El asesinato de un agente de la autoridad portuaria revela el posible paradero de Parsa, mientras el equipo continúa su caza incansable. Mientras tanto, Bishop revela su pasada conexión con el escurridizo terrorista.

Después de descubrir chalecos antibalas defectuosos en un camión robado lleno de mercancía del U.S.M.C, el equipo del NCIS intenta localizar la fuente y cualquier chaleco que haya sido enviado a personal militar extranjero.

Cuando DiNozzo se enfrenta a un hombre haciéndose pasar por un oficial de la Marina, las armas aparecen y el autor muere. La investigación posterior revela que el único testigo es el padre de DiNozzo, que está en la ciudad para revelar un secreto a su hijo.

Después de que una bomba estalle en el camerino en un concierto benéfico militar, el equipo del NCIS debe determinar si el objetivo era un rockero fracasado de los 80 o si la bomba era parte de un plan más amplio. Mientras tanto, Jimmy se prepara para la paternidad.

Gibbs se reune con un viejo colega tras el asesinato de un congresista en Nueva Orleans.

El equipo busca a un asesino imitador en Nueva Orleans.

Después de regresar a su trabajo en el Departamento de Defensa, la novia de McGee, Delilah, encuentra una brecha en un polémico caso, lo que la lleva a su vez pdir ayuda al equipo del NCIS. Mientras tanto, McGee habla con DiNozzo sobre si debe pedir Delilah que se mude con él.

Después de que un Oficial de la Marina es encontrado muerto en un camino rural, el equipo del NCIS debe determinar si el asesinato fue el resultado de una pelea en un bar, o porque sabía demasiado sobre el ataque a una Oficial compañera. Mientras tanto, DiNozzo y McGee comienzan una limpieza a base de zumo para purgar sus cuerpos de impurezas.

Cuando un Marine fotógrafo desaparece antes de proporcionar su testimonio en una audiencia de la corte marcial del ejército, el equipo del NCIS investiga tanto el asesinato del que fue testigo, así como su artículo sobre veteranos de guerra sin hogar en el área de Washington D.C. Mientras tanto, Abby intenta ayudar a que una joven mujer sin hogar vuelva a conectar con su familia.

El Director Vance da a DiNozzo la misión especial de traer de París a casa a la hija de un Almirante, pero debe recurrir a su equipo del NCIS en busca de ayuda después de que entre en la escena de un crimen controvertido.

El equipo del NCIS investiga si un incendio en un barco de la Marina estadounidense que servía como recinto secreto de detención de terroristas encausados fue accidental o una distracción para una fuga. Mientras tanto, Gibbs viaja a casa de su infancia tras la noticia de la muerte de su padre.