Un joven cirujano con autismo y Síndrome de Savant se traslada de Wyoming a California para completar su formación médica y confía en sus extraordinarias habilidades para refutar el escepticismo de sus colegas.

Cuando los prejuicios sobre su autismo obligan a Shaun a mantenerse al margen en el St. Bonaventure, sus colegas no dudan en atribuirse el mérito de sus ideas.

Mientras Shaun y Claire improvisan para conservar un hígado para un trasplante, Andrews recibe presión para que colabore con Melendez en una cirugía de rutina de un paciente.

El Dr. Neil Meléndez y el equipo tienen que navegar en aguas legales cuando una pareja tiene que tomar una decisión que cambie su vida sobre su hijo a punto de nacer. Mientras tanto, el Dr. Shaun Murphy se esfuerza por adaptarse a su nuevo entorno en casa y da un gran paso adelante con sus colegas.

Después de conocer a un paciente, Shaun sospecha que ha sido diagnosticado erroneamente con un tumor cerebral. Una reacción alérgica de un paciente mayor, revela una serie de problemas que tiene con su hijo.

Un accidente de autobús pone a prueba a Shaun y a sus compañeros en su primera noche en Urgencias.

Melendez se ve en una situación comprometida cuando los padres de un niño autista rehúsan que Shaun opere a su hijo.

Mientras Shaun trata a una mujer herida por un disparo, Claire se niega a tratar al autor del crimen por sus comentarios racistas.

Shaun y Melendez trabajan juntos para operar a un niño africano muy grave.

Mientras Shaun lucha por ser escuchado cuando sospecha que Melendez está pasando por alto el problema de un paciente, Claire se enfrenta al acoso sexual de un doctor muy respetado.

Shaun se une a Lea para un viaje improvisado. Melendez y Claire se enfrentan a un transplante entre dos hermanos siameses.

Mientras Shaun hace una revelación importante después de su viaje con Lea, el transplante entre los gemelos siameses se complica y pone en una situación compremetida a la madre y al equipo quirúrgico.

Shaun sospecha que las quemaduras que presentan los pulmones de un paciente, las causaron sustancias químicas utilizadas para fabricar bombas y Claire cuestiona los motivos que llevan a una mujer a rechazar la operación que salvaría la vida de su marido.

Mientras Shaun y Jared debaten cómo tratar el cáncer de una niña transgénero de doce años, Claire y una nueva residente competitiva deben trabajar juntas para salvar a un padre soltero de un parásito súper resistente a los medicamentos.

Una operación para corregir el defecto cardíaco de un adolescente pone en desacuerdo a Shaun y al Dr. Morgan. La experiencia de un nuevo residente como agente de policía lo lleva a dudar de los motivos de un asesino preso por querer ser un donante de órganos.

La repentina sensibilidad en las piernas de un hombre paralizado hace que Melendez sospeche que puede volver a caminar. Andrews debe deshacer una cirugía estética que salió mal para salvar la vida de una mujer.

Claire y Morgan no están de acuerdo sobre cómo tratar a un paciente que descubren que está utilizando una tarjeta de seguro robada. Shaun conecta una paciente adolescente que se prepara para una cirugía que le permitirá sonreír la primera vez.

El equipo del hospital necesita descubrir la verdad sobre las inexplicables heridas que sufre un joven estudiante antes de que su situación empeore. Mientras tanto, las distracciones de Shaun durante una cirugía podrían acabar con su privilegiada posición en el trabajo.