El tratamiento propuesto por Shaun para un indigente lo coloca a él y a Jared en el punto de mira de Andrews. Claire intenta convencer a Melendez de que ue debe hacer una arriesgada operación cardíaca. Glassman se enfrenta a una decisión difícil sobre su estado.

Mientras Shaun se enfrenta a Meléndez para tratar a un conserje del hospital gravemente enfermo, Lim se arriesga a una demanda por intentar reparar la circuncisión ritual de una adolescente. Glassman elige exhaustivamente un médico para su cirugía cerebral.

Al Dr. Meléndez, la Dr. Brown y el Dr. Park le han dado a una pareja joven de casados dos opciones sobre su futuro: salvar la vida de la mujer o su capacidad futura de formar una familia. Mientras tanto, cuando la Dra. Lim tiene que ocuparse de algunos asuntos personales, deja la supervisión de la sala de emergencias al Dr. Murphy y a la Dr. Reznick; y la recuperación postoperatoria del Dr. Glassman lo deja luchando por conseguir el descanso que necesita para recuperarse y también por confrontar su relación con su hija.

Shaun recuerda su propio pasado para ayudar a un adolescente con discapacidad intelectual a enfrentar la separación de su madre, mientras que Claire se encuentra entre un adolescente escalador herido y sus preocupados padre. Mientras tanto, las alucinaciones postoperatorias de Glassman lo obligan a enfrentar una tragedia personal.

Cuando una paciente que sufre anorexia no puede ganar el peso necesario para sobrevivir a una cirugía cardíaca, Claire sugiere que realicen una cirugía experimental a la que Meléndez se opone firmemente. A Shaun le preocupa que la negativa de Glassman a caminar por el suelo del hospital evite que sea dado de alta y trata de persuadirlo de que se mueva. Mientras tanto, Shaun y Lea cambian los términos de su relación actual.

La indecisión de Morgan y Shaun sobre cómo tratar a una joven violinista que visita la sala de emergencias con un dedo infectado podría afectar a su futuro en más de un sentido. Mientras tanto, Lim, Claire y Park no pueden averiguar si su joven paciente está realmente enferma o si solo busca atención.

El Dr. Shaun Murphy y la Dr. Morgan Reznick deben lidiar con dos hermanos que están negociando sobre la vida y la muerte. Mientras tanto, una amiga de la Dra. Claire Brown que se está muriendo de cáncer le pide algo que no cree que pueda darle; y el Dr. Aaron Glassman está lidiando con los efectos de su tratamiento.

El Dr. Murphy, la Dra. Lim y la Dra. Brown se ven obligados a revelar un secreto al esposo de una paciente después de que su tratamiento se complique. Mientras tanto, el Dr. Meléndez, la Dra. Reznick y el Dr. Park luchan por un paciente cuyos padres no creen en las vacunas.

El Dr. Meléndez, la Dra. Reznick y la Dra. Brown lidian con el deseo de un paciente de realizar una operación que evite que actúe de acuerdo con sus impulsos pedófilos. El Dr. Murphy aprende una lección sobre la empatía.

El Dr. Shaun Murphy y el Dr. Alex Park tratan a dos pacientes que se colapsan en el aeropuerto local y cuyos síntomas apuntan a una infección que puede transmitirse por el aire. Lo que desencadena en una cuarentena hospitalaria durante las vacaciones.

Con un médico agotado y recursos limitados, Shaun y Morgan se hacen cargo de urgencias en cuarentena. Andrews ayuda a Melendez y a Claire a realizar una extracción de médula improvisada en un intento por salvar la vida de su paciente con leucemia.

Tras la traumática cuarentena, los residentes pasan un día fuera del hospital para desahogarse. De vuelta, Andrews evita a un funcionario del departamento de salud.

Mientras tratan quirúrgicamente a un paciente con Trastorno del Espectro Autista, Shaun y Morgan se interesan por su "relación" con su compañero de habitación. Melendez, Claire y Park trabajan para salvar la vida de una mujer con un corazón mecánico, por lo que requieren ingeniería y experiencia médica a partes iguales.

El Dr. Andrews intenta convencer a una familia de luto para que done la cara de su hija adolescente a otra chica cuyo rostro quedó horriblemente desfigurado en un accidente.

La dura honestidad de Shaun con una madre consternada a causa de su bebé en estado crítico coloca al nuevo jefe de cirugía (Daniel Dae Kim) en una delicada situación, planteándose la posibilidad de mantenerlo como residente.

El nuevo jefe de cirugía, el Doctor Jackson Han (Daniel Dae Kim), cree que el Doctor Shaun Murphy es un lastre e intenta mantenerlo fuera de la sala de operaciones permanentemente.

El Doctor Shaun Murphy está desesperado por unirse al equipo involucrado en un complicado proceso para eliminar el tumor de un paciente. Sin embargo, habiendo sido apartado del equipo de cirugía por el Doctor Jackson Han (Daniel Dae Kim), Shaun debe usar su talento para descubrir la causa de las lesiones de su bebé.

Mientras que una pelea de bar envía al Doctor Shaun Murphy a buscar un tratamiento al San Bonaventure, el Doctor Park y la Doctora Lim están en desacuerdo con los síntomas postoperatorios de una mujer mayor. Por otra parte, el Doctor Meléndez y la Doctora Lim hacen pública su relación, y el Doctor Glassman continúa buscando la forma de continuar la relación con un buen amigo.