En otro intento por conseguir financiación para la agencia, Malory arrastra a sus agentes a la ciudad de lujo de Gstaad para proteger a la hija de un millonario suizo de un intento de secuestro. Pero Archer descubre pronto que la protegida es la verdadera amenaza: una menor de edad ninfómana que no se detendrá ante nada en su intento por llevar a la cama al mejor espía del mundo.

Después de que Malory tenga problemas con una operación fraudulenta, decide poner en marcha otra: vender su agencia a sus archienemigos. Archer y el resto de los empleados, temiendo por sus puestos de trabajo, tendrán que usar cada recurso a su alcance para detener la venta.

Archer recibe una visita inesperada: Trinette, su 'call girl' favorita, se presenta en la agencia con un bebé en la cintura y una citación para una prueba de paternidad en la mano. ¿Es Archer el padre del pequeño Seamos?

Mientras Malory intenta convertir la agencia en un espacio de trabajo responsable con el medio ambiente, Archer y Lana se dirigen a un pantano para evitar un desastre ecológico. El equipo de Archer para la misión incluye un bote, una escopeta recortada, un arco...

Cuando los miembros de las Fuerzas Aéreas Reales del escuadrón al que pertenecía Woodhouse empiecen a morir misteriosamente, Archer intentará ayudar a su leal criado a localizar al asesino, mientras tiene que hacerse cargo también del pequeño Seamos.

Cansado de que sus compañeros siempre lo consideren un fracasado, Cyril decide ayudar a George Spelvin, un misterioso experto en ordenadores, a insertar un virus en el sistema de la agencia para que Cyril pueda posteriormente eliminarlo y convertirse en un héroe. Pero como era de esperar, el plan fracasa: Cyril no contaba con las ninjas en bikini.

Las riñas infantiles, murmuraciones furtivas y celos menores se multiplican exponencialmente cuando una famosa actriz de Hollywood, Rona Thorne, pasa una semana siguiendo a los agentes como parte de su investigación para un papel en una película de espías. Y Malory podría matar ¿ literalmente ¿ por conseguir un papel en ella.

Después del breve susto de Malory con el cáncer de mama, otro agente decide hacerse la prueba, con resultados trágicos. El otro agente es Archer y el trágico resultado es que sí, tiene cáncer de mama. Es lo que pasa cuando llevas toda tu carrera desarmando cabezas nucleares y practicando sexo en máquinas de rayos X.

Cuando Archer descubre que las medicinas que ha estado tomando para el cáncer de mama son falsas se decide a capturar a los culpables. Esta vez es personal. Archer es una comedia animada situada en el Servicio Secreto de Inteligencia Internacional (ISIS), una agencia de espionaje donde más que perseguir a los malos, se dedican a cotillear, y pelear entre ellos.

La agencia queda cerrada con los agentes dentro después de que Pam sea secuestrada, aunque el objetivo de los secuestradores era Cheryl/Carol. Y es que la secretaria no es quien dice ser. ¿O sí?

Cuando un misterioso extraño convoque a Malory y sus intrépidos agentes en Mónaco, ¡se abren las apuestas! Y es que Mónaco es básicamente un casino gigante, y Archer tiene cuatro millones de dólares en bonos al portador.

La investigación de Archer sobre la identidad de su padre le lleva más allá del Telón de Acero. Viejas heridas se reabren cuando un agente de la agencia de la competencia es enviado para rescatar a Archer, quien se enamora de una bella y misteriosa mujer.

La desconfianza y los celos se extienden en la agencia cuando Krieger se acerca a conseguir un proyecto secreto. Archer trae a casa a la bella y misteriosa exagente del KGB Katya Kazanova para que conozca a Malory.