Jane es recapturada por la CIA y accede a convertirse en un agente triple.

Weller y sus compañeros de equipo en el FBI, comienzan a investigar el verdadero mapa que son los tatuajes de Jane Doe, arrastrándoles a un submundo de alto riesgo a través de un laberinto de secretos y revelaciones.

Weller y su equipo deben correr contra el tiempo para detener una serie de atentados en New York, mientras Jane es obligada a emprender una misión de asesinato para demostrar su lealtad o sufrir las consecuencias.

Nas y Weller exploran su nueva dinámica como colíderes mientras su equipo caza en la gala de un museo a una asesina que termina albergando un oscuro secreto. En medio de esta misión, Jane descubre el lado más blanco de su antigua organización.

Weller y el equipo deben trabajar con Allie Knight para acabar con un líder de la mafia.

Mientras Weller y Nas persiguen a un informante fugitivo en Bulgaria, Jane va en una misión de Sandstorm con Roman. Reade y Zapata deben hacer frente a un problema urgente.

Rich Dotcom regresa al FBI para pedirles ayuda con un asunto importante.

Jane y Wellner desaparecen así que el equipo intenta descubrir su paradero interrogando a dos criminales que pueden tener información.

Después de que Jane descubre que Sandstorm se está preparando para un ataque inminente, ella arriesga todo para enviar un SOS secreto a su equipo del FBI.

Patterson está desaparecida y un Roman amnésico está en libertad. Jane y Weller deben competir con Shepherd - y el reloj - para encontrarlos antes de que sea demasiado tarde.

Después de que uno de los terroristas más buscados del mundo aparece en New York por razones desconocidas, el equipo debe trabajar con la CIA para detener un bombardeo mortal.

Cuando un tatuaje inusual conduce a Roman, el equipo debe decidir si lo enviará para ir encubierto con una pandilla de motociclistas peligrosos.

El equipo obtiene un dato importante en el caso Sandstorm cuando descubren la verdadera identidad de Shepherd, y una conexión entre ella y Weller.

El equipo debe infiltrarse en una sociedad secreta con el fin de solucionar el enigma de otro tatuaje.

Después de que un conjunto de tatuajes generan múltiples pistas, el equipo se divide en parejas - Weller y Roman; Jane y Zapata; Patterson y Reade - para perseguir a un mensajero peligroso.

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Jane y Oliver se encuentran en una situación peligrosa que expone los secretos que ambos ocultaron. Con dudas de si pueden confiar el uno en el otro, la pareja debe permanecer viva mientras Weller y el equipo tratan de salvarlos.

Bajo la investigación de un viejo rival, el equipo lucha por defenderse. Mientras tanto, un tatuaje los lleva a una muerte misteriosa en un hogar adoptivo.

Jane y Weller trabajan encubierto para conseguir unos documentos clasificados. Mientras Shepherd viaja a Tailandia para conseguir un arma peligrosa.

Las transgresiones de Zapata la alcanzan y es enviada a la cárcel junto a una activa de Sandstorm llamada Devon, Weller y el equipo tendrán que hacer lo imposible para ayudarla.

El equipo finalmente obtiene un avance sobre la Fase Dos del plan de Sandstorm.

Mientras el FBI se enfrenta a una tragedia, Weller se encuentra en el centro de un evento sorprendente y Jane se enfrenta a un futuro incierto.