Kevin Flynn, el creador de TRON, lleva 20 años desaparecido. Sam Flynn ha heredado el imperio de su padre pero no tiene ningún interés en la empresa. Tras recibir un misterioso mensaje, Sam decide investigar la vieja oficina de su padre, donde encuentra una máquina que lo introduce en un mundo virtual, donde descubrirá por qué su padre no ha podido regresar a casa.