Lyra Belacqua es una niña huérfana que vive en un mundo donde todos los humanos tienen un "daimonion": Una manifestación de su alma en forma de animal, con personalidad propia. Su sencilla vida cambiará cuando ella y su daimonion, Pantalaimon, frustren un intento de asesinato y descubran los secretos de unas partículas llamadas "Polvo", que parecen tener consciencia propia.