El puente Bifrost has ido reconstruido y la paz en los Nueve Reinos se ha reestablecido y todo gracias a Thor (Chris Hemsworth) y a la gente de Asgard, mientras tanto en la Tierra, Jane Foster (Natalie Portman), intenta encontrar a Thor pero en su búsqueda se topa con el Aether, una antigua reliquia propiedad de la raza de los elfos oscuros, con la cual pretenden hundir al Universo en la oscuridad perpetua, lo que desata una guerra entre estos y Asgard. Thor, en un intento de frenar a los elfos oscuros y a su líder Malekith (Christopher Eccleston), recurre a su hermano Loki (Tom Hiddleston) y así detener la oscuridad que se cierne sobre ellos.